Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uhrf1bp1B2KF50 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms