Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfx1B1AY10 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms