Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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