Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms