Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan4dA7KBS4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 444 ms