Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5640A3KG49 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms