Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r232A2RTT5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms