Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Samt1A2BED8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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