Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms