Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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