Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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