Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Cavin4A2AMM0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cavin4A2AMM0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms