Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd1A2AKB4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms