Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramel3A2AHA7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms