Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms