Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms