Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms