Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt16Q9Z2K1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms