Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn6Q9Z262 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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