Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms