Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Sh3bp5Q9Z131 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5Q9Z131 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms