Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn9Q9Z0S7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn9Q9Z0S7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms