Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn13Q9Z0S4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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