Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snx1Q9WV80 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx1Q9WV80 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms