Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnn1bQ9WU38 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms