Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Wdr54Q9R0D8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms