Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11cQ9QZW0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms