Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpc3Q9QZC1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms