Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Six6Q9QZ28 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Six6Q9QZ28 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Six6Q9QZ28 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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