Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms