Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms