Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms