Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms