Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp1Q9JLK7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp1Q9JLK7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms