Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms