Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smco4Q9JIS3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smco4Q9JIS3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smco4Q9JIS3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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