Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc4Q9ES56 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms