Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop7Q9DCH2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms