Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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