Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne8Q9DC53 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms