Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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