Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms