Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms