Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms