Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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