Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms