Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms