Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm5Q9D6G9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms