Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms