Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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